La définition des "espèces" est délicate. Selon la focalisation d'une personne et le besoin de définition, l'idée du concept d'espèce peut être différente. La plupart des scientifiques de base conviennent que la définition commune du mot "espèce" est un groupe d'individus similaires qui vivent ensemble dans une zone et peuvent se croiser pour produire une progéniture fertile. Cependant, cette définition n'est pas vraiment complète. Il ne peut pas être appliqué à une espèce qui subit une reproduction asexuée car le «métissage» ne se produit pas dans ces types d'espèces. Par conséquent, il est important que nous examinions tous les concepts d'espèces pour voir lesquels sont utilisables et lesquels ont des limites..
Le concept d'espèce le plus universellement accepté est l'idée d'espèce biologique. C'est le concept d'espèce d'où provient la définition généralement acceptée du terme "espèce". D'abord proposé par Ernst Mayr, le concept d'espèce biologique dit explicitement,
"Les espèces sont des groupes de populations naturelles réellement ou potentiellement métissées qui sont isolées de manière reproductrice d'autres groupes de ce type."
Cette définition met en jeu l'idée d'individus d'une seule espèce pouvant se croiser tout en restant reproductivement isolés les uns des autres.
Sans isolement reproductif, la spéciation ne peut pas avoir lieu. Les populations doivent être divisées pour plusieurs générations de descendants afin de s'écarter de la population ancestrale et devenir de nouvelles espèces indépendantes. Si une population n'est pas divisée, soit physiquement à travers une sorte de barrière, soit de manière reproductrice par le biais de comportements ou d'autres types de mécanismes d'isolement prézygotique ou postzygotique, alors l'espèce restera comme une seule espèce et ne divergent pas et ne devient pas sa propre espèce distincte. Cet isolement est au cœur du concept d'espèce biologique.
La morphologie est à quoi ressemble un individu. Ce sont leurs caractéristiques physiques et leurs parties anatomiques. Lorsque Carolus Linnaeus a proposé sa taxonomie de nomenclature binomiale, tous les individus étaient regroupés par morphologie. Par conséquent, le premier concept du terme "espèce" était basé sur la morphologie. Le concept d'espèce morphologique ne prend pas en compte ce que nous savons maintenant de la génétique et de l'ADN et comment il affecte à quoi ressemble un individu. Linné ne connaissait pas les chromosomes et les autres différences microévolutionnaires qui font en fait que certains individus qui ressemblent à une partie d'espèces différentes.
Le concept d'espèce morphologique a définitivement ses limites. Premièrement, il ne fait pas de distinction entre les espèces qui sont réellement produites par l'évolution convergente et qui ne sont pas vraiment étroitement liées. Il ne regroupe pas non plus les individus de la même espèce qui se trouveraient être quelque peu morphologiquement différents comme en couleur ou en taille. Il est beaucoup plus précis d'utiliser le comportement et les preuves moléculaires pour déterminer ce qu'est la même espèce et ce qui ne l'est pas..
Une lignée est similaire à ce qui serait considéré comme une branche sur un arbre généalogique. Les arbres phylogentiques de groupes d'espèces apparentées se ramifient dans toutes les directions où de nouvelles lignées sont créées à partir de la spéciation d'un ancêtre commun. Certaines de ces lignées prospèrent et vivent et certaines disparaissent et cessent d'exister avec le temps. Le concept d'espèce de lignée devient important pour les scientifiques qui étudient l'histoire de la vie sur Terre et le temps de l'évolution.
En examinant les similitudes et les différences des différentes lignées qui sont liées, les scientifiques peuvent déterminer très probablement quand les espèces ont divergé et évolué par rapport à l'époque où l'ancêtre commun était autour. Cette idée d'espèces de lignée peut également être utilisée pour adapter des espèces à reproduction asexuée. Étant donné que le concept d'espèce biologique dépend de l'isolement reproductif des espèces à reproduction sexuée, il ne peut pas nécessairement être appliqué à une espèce qui se reproduit asexuellement. Le concept d'espèce de lignée n'a pas cette contrainte et peut donc être utilisé pour expliquer des espèces plus simples qui n'ont pas besoin d'un partenaire pour se reproduire.