Comment faire un tampon d'électrophorèse 10X TBE

Le TBE et le TAE sont utilisés comme tampons en biologie moléculaire, principalement pour l'électrophorèse des acides nucléiques. Les tampons Tris sont utilisés dans des conditions de pH légèrement basiques, comme pour l'électrophorèse d'ADN, car cela maintient l'ADN soluble dans la solution et déprotoné de sorte qu'il sera attiré par l'électrode positive et migrera à travers un gel. L'EDTA est un ingrédient de la solution car cet agent chélatant commun protège les acides nucléiques de la dégradation par les enzymes. L'EDTA chélate les cations divalents qui sont des cofacteurs des nucléases qui peuvent contaminer l'échantillon. Cependant, comme le cation magnésium est un cofacteur de l'ADN polymérase et des enzymes de restriction, la concentration d'EDTA est volontairement faible (concentration d'environ 1 mM).

Matériaux de tampon d'électrophorèse 10X TBE

• 108 g de base Tris [tris (hydroxyméthyl) aminométhane]
• 55 g d'acide borique
• 7,5 g d'EDTA, sel disodique
• Eau déminéralisée

Préparation pour le tampon d'électrophorèse 10X TBE

1. Dissoudre le Tris, l'acide borique et l'EDTA dans 800 ml d'eau désionisée.
2. Diluer le tampon à 1 L. Des amas blancs non dissous peuvent être dissous en plaçant le flacon de solution dans un bain d'eau chaude. Une barre d'agitation magnétique peut faciliter le processus.

Vous n'avez pas besoin de stériliser la solution. Bien que des précipitations puissent se produire après un laps de temps, la solution mère est toujours utilisable. Vous pouvez ajuster le pH à l'aide d'un pH-mètre et l'ajout goutte à goutte d'acide chlorhydrique concentré (HCl). Il est bon de stocker le tampon TBE à température ambiante, bien que vous souhaitiez peut-être filtrer la solution mère à travers un filtre de 0,22 micron pour éliminer les particules qui favoriseraient les précipitations.

Stockage de tampon d'électrophorèse 10X TBE

Conservez le flacon de solution tampon 10X à température ambiante. La réfrigération accélérera les précipitations.

Utilisation du tampon d'électrophorèse 10X TBE

La solution est diluée avant utilisation. Diluer 100 ml de bouillon 10X à 1 L avec de l'eau déionisée.

Recette de solution mère 5X TBE

L'avantage de la solution 5X est qu'elle est moins susceptible de précipiter.

• 54 g de base Tris (Trizma)
• 27,5 grammes d'acide borique
• 20 ml de solution EDTA 0,5 M
• Eau déminéralisée

Préparation

1. Dissoudre la base Tris et l'acide borique dans la solution d'EDTA.
2. Ajuster le pH de la solution à 8,3 en utilisant du HCl concentré.
3. Diluez la solution avec de l'eau désionisée pour faire 1 litre de solution mère 5X. La solution peut également être diluée à 1X ou 0,5X pour l'électrophorèse.

L'utilisation accidentelle d'une solution mère 5X ou 10X vous donnera de mauvais résultats car autant de chaleur sera générée. En plus de vous donner une mauvaise résolution, l'échantillon peut être endommagé.

Recette de tampon 0,5 TBA

• Solution mère 5X TBE
• Eau déionisée distillée

Préparation

Ajouter 100 ml de la solution 5X TBE à 900 ml d'eau désionisée distillée. Bien mélanger avant utilisation.

Limites

Bien que TBE et TAE soient des tampons d'électrophorèse courants, il existe d'autres options pour les solutions conductrices à faible molarité, y compris le tampon borate de lithium et le tampon borate de sodium. Le problème avec TBE et TAE est que les tampons à base de Tris limitent le champ électrique qui peut être utilisé en électrophorèse car trop de charge provoque une température d'emballement.