Mary Daly, élevée dans un foyer catholique et envoyée dans des écoles catholiques tout au long de son enfance, a poursuivi ses études de philosophie puis de théologie à l'université. Lorsque l'Université catholique ne lui a pas permis, en tant que femme, d'étudier la théologie pour un doctorat, elle a trouvé un petit collège pour femmes qui offrait un doctorat. en théologie.
Après avoir travaillé pendant quelques années comme instructeur au Cardinal Cushing College, Daly est allé en Suisse pour y étudier la théologie et obtenir un autre doctorat. Tout en poursuivant ses études à l'Université de Fribourg, elle a enseigné le programme Junior Year Abroad pour les étudiants américains.
De retour aux États-Unis, Mary Daly a été embauchée comme professeure adjointe de théologie par le Boston College. La controverse a suivi la publication de son livre de 1968, L'Église et le deuxième sexe: vers une philosophie de libération des femmes, et le collège a tenté de licencier Mary Daly mais a été forcé de la réengager lorsqu'on lui a présenté une pétition d'étudiant signée par 2 500.
Mary Daly a été promue professeure agrégée de théologie en 1969, un poste permanent. Alors que ses livres l'éloignaient de plus en plus du cercle du catholicisme et du christianisme, le collège refusa les promotions de Daly au poste de professeur titulaire en 1974 puis en 1989.
Le collège s'est opposé à la politique de Daly de refuser d'admettre des hommes à ses cours d'éthique féministe, bien qu'elle ait proposé d'enseigner aux hommes individuellement et en privé. Elle a reçu cinq avertissements sur cette pratique du collège.
En 1999, un procès intenté au nom de la haute Duane Naquin, soutenu par le Center for Individual Rights, a conduit à son licenciement..
Naquin n'avait pas suivi le cours préalable sur les études féminines, il a essayé de s'inscrire et Daly lui a dit qu'il pouvait suivre le cours avec elle individuellement..
Cet étudiant a été soutenu par le Center for Individual Rights, une organisation qui s'oppose au titre IX, et une tactique utilisée consiste à intenter des actions en justice pour appliquer le titre IX aux étudiants de sexe masculin..
En 1999, face à ce procès, le Boston College a mis fin au contrat de Mary Daly en tant que professeur titulaire. Elle et ses partisans ont intenté une action en justice et demandé une injonction contre le licenciement, au motif que les garanties d'une procédure régulière n'avaient pas été respectées..
En février 2001, les partisans de Boston College et de Mary Daly ont annoncé que Daly s'était réglé à l'amiable avec Boston College, retirant ainsi l'affaire des mains du tribunal et du juge..
Elle n'est pas retournée à l'enseignement, y mettant officiellement fin à sa chaire en 2001.
Mary Daly a publié son compte rendu de ce combat dans son livre de 2006, Amazing Grace: Re-calling the Courage to Sin Big.
Le point de vue de Mary Daly sur le transsexualisme dans son livre de 1978 Gynécologie est fréquemment citée par les féministes radicales qui ne soutiennent pas l'inclusion des transsexuels hommes-femmes en tant que femmes:
Le transsexualisme est un exemple de fils chirurgicaux masculins qui envahissent le monde féminin avec des substituts.