À l'âge de 20 ans, en 1520, Charles V dirigeait la plus grande collection de terres européennes depuis Charlemagne plus de 700 ans plus tôt. Charles était duc de Bourgogne, roi de l'empire espagnol et des territoires des Habsbourg, qui comprenait l'Autriche et la Hongrie, ainsi que l'empereur romain germanique; il a continué à acquérir plus de terres tout au long de sa vie. Problématique pour Charles, mais intéressant pour les historiens, il a acquis ces terres au coup par coup - il n'y avait pas un seul héritage - et de nombreux territoires étaient des pays indépendants avec leurs propres systèmes de gouvernement et peu d'intérêt commun. Cet empire, ou monarchie, peut avoir apporté le pouvoir à Charles, mais cela lui a aussi causé de grands problèmes.
Charles a hérité de l'Empire espagnol en 1516; cela comprenait l'Espagne péninsulaire, Naples, plusieurs îles de la Méditerranée et de grandes étendues d'Amérique. Bien que Charles ait clairement le droit d'hériter, la manière dont il l'a fait a bouleversé: en 1516, Charles est devenu régent de l'Empire espagnol au nom de sa mère malade mentale. Quelques mois plus tard, avec sa mère toujours en vie, Charles se déclare roi.
La manière dont Charles a accédé au trône a bouleversé certains Espagnols souhaitant que sa mère reste au pouvoir; d'autres soutenaient le petit frère de Charles comme héritier. D'un autre côté, nombreux étaient ceux qui affluaient à la cour du nouveau roi. Charles a causé plus de problèmes dans la manière dont il a initialement gouverné le royaume: certains craignaient qu'il était inexpérimenté, et certains Espagnols craignaient que Charles ne se concentre sur ses autres terres, telles que celles qu'il devait hériter de l'empereur romain germanique Maximilien. Ces craintes ont été exacerbées par le temps qu'il a fallu à Charles pour mettre de côté ses autres affaires et se rendre en Espagne pour la toute première fois: dix-huit mois.
Charles a causé d'autres problèmes, beaucoup plus tangibles, quand il est arrivé en 1517. Il a promis à un rassemblement de villes appelées les Cortes qu'il ne nommerait pas d'étrangers à des postes importants; il a ensuite émis des lettres de naturalisation de certains étrangers et les a nommés à des postes importants. En outre, après avoir reçu une importante subvention à la couronne par les Cortes de Castille en 1517, Charles a rompu avec la tradition et a demandé un autre paiement important pendant le premier. Jusqu'à présent, il avait passé peu de temps en Castille et l'argent était destiné à financer sa revendication du trône romain, une aventure étrangère redoutée par les Castillans. Cela, et sa faiblesse en ce qui concerne la résolution des conflits internes entre les villes et les nobles, ont provoqué une grande colère.
Au cours des années 1520 - 21, l'Espagne a connu une rébellion majeure au sein de son royaume castillan, un soulèvement qui a été décrit comme "la plus grande révolte urbaine du début de l'Europe moderne". (Bonney, Les États dynastiques européens, Longman, 1991, p. 414) Bien que certainement vrai, cette affirmation masque une composante rurale plus tardive, mais toujours importante. Il y a toujours un débat sur la fin de la révolte, mais cette rébellion des villes castillanes - qui ont formé leurs propres conseils locaux, ou `` communes '' - comprenait un véritable mélange de mauvaise gestion contemporaine, de rivalité historique et d'intérêt politique. Charles n'était pas complètement à blâmer, car la pression avait augmenté au cours du dernier demi-siècle lorsque les villes se sont senties de plus en plus en perte de pouvoir face à la noblesse et à la couronne.
Les émeutes contre Charles avaient commencé avant même d'avoir quitté l'Espagne en 1520, et à mesure que les émeutes se propageaient, les villes ont commencé à rejeter son gouvernement et à former le leur: des conseils appelés comuneros. En juin 1520, alors que les nobles restaient tranquilles, espérant profiter du chaos, les comuneros se rencontrèrent et se formèrent ensemble dans la Santa Junta (Holy League). Le régent de Charles a envoyé une armée pour faire face à la rébellion, mais cela a perdu la guerre de propagande quand il a déclenché un incendie qui a ravagé Medina del Campo. Plus de villes ont ensuite rejoint la Santa Junta.
Alors que la rébellion se propageait dans le nord de l'Espagne, la Santa Junta a d'abord tenté de rallier la mère de Charles V, la vieille reine. Lorsque cela a échoué, la Santa Junta a envoyé une liste de demandes à Charles, une liste destinée à le garder roi et à modérer ses actions et à le rendre plus espagnol. Les demandes incluaient le retour de Charles en Espagne et l'octroi aux Cortès d'un rôle beaucoup plus important dans le gouvernement.
Alors que la rébellion grandissait, des fissures sont apparues dans l'alliance des villes, chacune ayant son propre programme. La pression du ravitaillement des troupes a également commencé à se faire sentir. La rébellion s'est étendue à la campagne, où les gens ont dirigé leur violence contre la noblesse ainsi que contre le roi. C'était une erreur, car les nobles qui s'étaient contentés de laisser la révolte se poursuivre réagissaient maintenant contre la nouvelle menace. Ce sont les nobles qui ont exploité Charles pour négocier un règlement et une noble armée dirigée qui a écrasé les comuneros au combat.
La révolte a effectivement pris fin après que la Santa Junta a été vaincue lors de la bataille de Villalar en avril 1521, bien que les poches soient restées jusqu'au début de 1522. La réaction de Charles n'a pas été sévère compte tenu des normes de l'époque, et les villes ont conservé bon nombre de leurs privilèges. Cependant, les Cortes ne devaient jamais gagner plus de pouvoir et devinrent une banque glorifiée pour le roi.
Charles a fait face à une autre rébellion qui s'est produite en même temps que la révolte de Comunero, dans une région d'Espagne plus petite et moins importante financièrement. C'était la Germanie, née d'une milice créée pour combattre les pirates barbaresques, un conseil qui voulait créer une Venise comme une cité-État, et la colère de classe autant qu'une aversion pour Charles. La rébellion a été écrasée par la noblesse sans beaucoup d'aide de la couronne.
Charles est revenu en Espagne en 1522 pour retrouver le pouvoir royal. Au cours des prochaines années, il a travaillé pour changer la relation entre lui et les Espagnols, en apprenant le castillan, en épousant une femme ibérique et en appelant l'Espagne au cœur de son empire. Les villes étaient inclinées et pouvaient se rappeler ce qu'elles avaient fait si jamais elles s'opposaient à Charles, et les nobles s'étaient battus pour se rapprocher de lui..