Tous les êtres vivants doivent avoir des sources d'énergie constantes pour continuer à exécuter même les fonctions vitales les plus élémentaires. Que cette énergie provienne directement du soleil par la photosynthèse ou en mangeant des plantes ou des animaux, l'énergie doit être consommée puis transformée en une forme utilisable comme l'adénosine triphosphate (ATP).
De nombreux mécanismes peuvent convertir la source d'énergie d'origine en ATP. Le moyen le plus efficace est la respiration aérobie, qui nécessite de l'oxygène. Cette méthode donne le plus d'ATP par apport d'énergie. Cependant, si l'oxygène n'est pas disponible, l'organisme doit toujours convertir l'énergie en utilisant d'autres moyens. Ces processus qui se produisent sans oxygène sont appelés anaérobies. La fermentation est un moyen courant pour les êtres vivants de fabriquer de l'ATP sans oxygène. Est-ce que cela fait de la fermentation la même chose que la respiration anaérobie?
La réponse courte est non. Même s'ils ont des parties similaires et n'utilisent pas d'oxygène, il existe des différences entre la fermentation et la respiration anaérobie. En fait, la respiration anaérobie ressemble beaucoup plus à la respiration aérobie qu'à la fermentation.
La plupart des cours de sciences ne traitent de la fermentation que comme alternative à la respiration aérobie. La respiration aérobie commence par un processus appelé glycolyse, dans lequel un glucide tel que le glucose est décomposé et, après avoir perdu certains électrons, forme une molécule appelée pyruvate. S'il y a un apport suffisant d'oxygène, ou parfois d'autres types d'accepteurs d'électrons, le pyruvate se déplace vers la partie suivante de la respiration aérobie. Le processus de glycolyse fait un gain net de 2 ATP.
La fermentation est essentiellement le même processus. Le glucide est décomposé, mais au lieu de faire du pyruvate, le produit final est une molécule différente selon le type de fermentation. La fermentation est le plus souvent déclenchée par un manque de quantités suffisantes d'oxygène pour continuer à parcourir la chaîne respiratoire aérobie. Les humains subissent une fermentation d'acide lactique. Au lieu de finir avec du pyruvate, l'acide lactique est créé. Les coureurs de fond connaissent bien l'acide lactique, qui peut s'accumuler dans les muscles et provoquer des crampes.
D'autres organismes peuvent subir une fermentation alcoolique, où le résultat n'est ni du pyruvate ni de l'acide lactique. Dans ce cas, l'organisme fabrique de l'alcool éthylique. D'autres types de fermentation sont moins courants, mais tous donnent des produits différents selon l'organisme en cours de fermentation. La fermentation n'utilisant pas la chaîne de transport d'électrons, elle n'est pas considérée comme un type de respiration.
Même si la fermentation se produit sans oxygène, ce n'est pas la même chose que la respiration anaérobie. La respiration anaérobie commence de la même manière que la respiration aérobie et la fermentation. La première étape est toujours la glycolyse, et elle crée toujours 2 ATP à partir d'une molécule de glucide. Cependant, au lieu de se terminer par la glycolyse, comme le fait la fermentation, la respiration anaérobie crée du pyruvate et continue ensuite sur le même chemin que la respiration aérobie.
Après avoir fabriqué une molécule appelée acétyl coenzyme A, elle continue jusqu'au cycle de l'acide citrique. Plus de porteurs d'électrons sont fabriqués, puis tout se retrouve dans la chaîne de transport d'électrons. Les porteurs d'électrons déposent les électrons au début de la chaîne, puis, grâce à un processus appelé chimiosmose, produisent de nombreux ATP. Pour que la chaîne de transport d'électrons continue de fonctionner, il doit y avoir un accepteur final d'électrons. Si cet accepteur est l'oxygène, le processus est considéré comme la respiration aérobie. Cependant, certains types d'organismes, y compris de nombreux types de bactéries et d'autres micro-organismes, peuvent utiliser différents accepteurs d'électrons finaux. Ceux-ci incluent les ions nitrate, les ions sulfate ou même le dioxyde de carbone.
Les scientifiques pensent que la fermentation et la respiration anaérobie sont des processus plus anciens que la respiration aérobie. Le manque d'oxygène dans l'atmosphère de la Terre au début a rendu impossible la respiration aérobie. Grâce à l'évolution, les eucaryotes ont acquis la capacité d'utiliser les «déchets» d'oxygène de la photosynthèse pour créer une respiration aérobie.