En juillet 1793, la révolution était à son plus bas niveau. Les forces ennemies avançaient sur le sol français, les navires britanniques planaient près des ports français dans l'espoir de se relier aux rebelles, la Vendée était devenue une région de rébellion ouverte et les révoltes fédéralistes étaient fréquentes. Les Parisiens craignaient que Charlotte Corday, l'assassin de Marat, ne soit que l'un des milliers de rebelles provinciaux opérant dans la capitale prêts à terrasser massivement les chefs de la révolution. Pendant ce temps, des luttes de pouvoir entre les sans-culottes et leurs ennemis avaient commencé à éclater dans de nombreux quartiers de Paris. Tout le pays se déroulait dans une guerre civile.
Cela a empiré avant de s'améliorer. Alors que de nombreuses révoltes fédéralistes s'effondraient sous les pressions locales - pénuries alimentaires, peur des représailles, réticents à marcher loin - et les actions des députés à la Convention envoyés en mission, le 27 août 1793, Toulon accepta une offre de protection contre une flotte britannique qui naviguait au large, se déclarant en faveur de l'enfant Louis VII et accueillant les Britanniques au port.
Alors que le Comité de salut public n'était pas un gouvernement exécutif - le 1er août 1793, la Convention refusa une motion demandant qu'il devienne le gouvernement provisoire; c'était la France la plus proche de quiconque était en charge de l'ensemble, et elle se déplaçait pour relever le défi avec une impitoyable totale. Au cours de la prochaine année, le comité a mobilisé les ressources du pays pour faire face à ses nombreuses crises. Il a également présidé la période la plus sanglante de la révolution: La Terreur.
Marat a peut-être été tué, mais de nombreux citoyens français transmettaient toujours ses idées, principalement que seule l'utilisation extrême de la guillotine contre les traîtres, les suspects et les contre-révolutionnaires résoudrait les problèmes du pays. Ils pensaient que la terreur était nécessaire - pas une terreur figurative, pas une posture, mais une véritable domination gouvernementale par la terreur.
Les députés de la Convention ont de plus en plus répondu à ces appels. Il y a eu des plaintes concernant un «esprit de modération» dans la Convention et une autre série de hausses de prix a été rapidement imputée aux députés «endormers» ou «dozer» (comme dans le sommeil). Le 4 septembre 1793, une manifestation pour plus de salaires et de pain fut rapidement tournée à l'avantage de ceux qui appelaient au terrorisme, et ils revinrent le 5 mars pour marcher vers la Convention. Chaumette, appuyée par des milliers de sans-culottes, a déclaré que la Convention devrait s'attaquer aux pénuries par une application stricte des lois.
La Convention a accepté et a en outre voté pour enfin organiser les armées révolutionnaires que le peuple avait agitées pendant les mois précédents pour marcher contre les amasseurs et les membres non patriotes de la campagne, bien qu'ils aient rejeté la demande de Chaumette pour que les armées soient accompagnées de guillotines sur roues pour une justice encore plus rapide. En outre, Danton a fait valoir que la production d'armes devrait être augmentée jusqu'à ce que chaque patriote ait un mousquet et que le Tribunal révolutionnaire devrait être divisé pour accroître l'efficacité. Les sans-culottes avaient une fois de plus imposé leurs souhaits à la Convention et à travers celle-ci; la terreur était maintenant en vigueur.
Le 17 septembre, une loi sur les suspects a été introduite permettant l'arrestation de toute personne dont la conduite suggère qu'ils étaient partisans de la tyrannie ou du fédéralisme, une loi qui pourrait facilement être modifiée pour toucher à peu près tout le monde dans la nation. La terreur pourrait être appliquée à tout le monde, facilement. Il y avait aussi des lois contre les nobles qui avaient été tout sauf zélés dans leur soutien à la révolution. Un maximum a été fixé pour un large éventail de produits alimentaires et de biens et les armées révolutionnaires se sont formées et se sont mises à la recherche de traîtres et à écraser la révolte. Même le discours était affecté, le «citoyen» devenant la manière populaire de se référer aux autres; ne pas utiliser le terme était un motif de suspicion.
On oublie généralement que les lois adoptées pendant la Terreur vont au-delà de la simple lutte contre les différentes crises. La loi Bocquier du 19 décembre 1793 prévoit un système d'enseignement public obligatoire et gratuit pour tous les enfants âgés de 6 à 13 ans, mais avec un programme mettant l'accent sur le patriotisme. Les enfants sans-abri sont également devenus une responsabilité de l'État et les personnes nées hors mariage ont bénéficié de tous les droits de succession. Un système universel de poids et mesures métriques a été introduit le 1er août 1793, tandis qu'une tentative de mettre fin à la pauvreté a été faite en utilisant la propriété des «suspects» pour aider les pauvres.
Cependant, ce sont les exécutions pour lesquelles la Terreur est si tristement célèbre, et celles-ci ont commencé avec l'exécution d'une faction appelée les Enrages, qui a été rapidement suivie par l'ancienne reine, Marie Antoinette, le 17 octobre et de nombreux Girondins le 31 octobre. . Environ 16 000 personnes (sans compter les décès en Vendée, voir ci-dessous) sont allées à la guillotine au cours des neuf mois suivants, car la Terreur a été à la hauteur de son nom, et environ la même chose est également décédée, généralement en prison.
A Lyon, qui se rendit fin 1793, le Comité de salut public décide de donner l'exemple et il y en a tellement à guillotiner que du 4 au 8 décembre 1793 personnes sont exécutées en masse par des coups de canon. Des quartiers entiers de la ville ont été détruits et 1880 tués. A Toulon, qui a été repris le 17 décembre grâce à un capitaine Bonaparte et son artillerie, 800 ont été abattus et près de 300 guillotinés. Marseille et Bordeaux, qui ont également capitulé, se sont échappés relativement légèrement avec «seulement» des centaines exécutés.
La contre-offensive du Comité de salut public a plongé la terreur au cœur de la Vendée. Les forces gouvernementales ont également commencé à gagner des batailles, forçant une retraite qui a tué environ 10 000 personnes et «les blancs» ont commencé à fondre. Mais la défaite finale de l'armée vendéenne à Savenay n'est pas finie, car la répression s'ensuit, ravage la région, brûle des étendues de terre et massacre environ un quart de million de rebelles. A Nantes, le député de mission, Carrier, a ordonné de ligoter les «coupables» sur des péniches qui ont ensuite coulé dans la rivière. C'étaient les noyades et ils ont tué au moins 1800 personnes.
Les actions de Carrier étaient typiques de l'automne 1793, lorsque les députés en mission prirent l'initiative de répandre la terreur à l'aide d'armées révolutionnaires, qui pouvaient atteindre 40 000 hommes. Ceux-ci étaient normalement recrutés dans la zone locale où ils devaient opérer et étaient généralement composés d'artisans des villes. Leurs connaissances locales étaient essentielles pour rechercher des amasseurs et des traîtres, généralement de la campagne.
Environ un demi-million de personnes pourraient avoir été emprisonnées dans toute la France et 10 000 pourraient être mortes en prison sans jugement. De nombreux lynchages ont également eu lieu. Cependant, cette première phase de la terreur ne visait pas, comme le rappelle la légende, les nobles, qui ne représentaient que 9% des victimes; le clergé était de 7%. La plupart des exécutions ont eu lieu dans les zones fédéralistes après que l'armée a repris le contrôle et que certaines zones loyales se sont échappées en grande partie indemnes. C'était des gens normaux et ordinaires, tuant des masses d'autres gens normaux et ordinaires. C'était une guerre civile, pas une classe.
Pendant la Terreur, les députés en mission ont commencé à attaquer les symboles du catholicisme: briser des images, vandaliser des bâtiments et brûler des vêtements. Le 7 octobre, à Reims, l'huile sacrée de Clovis qui servait à oindre les rois de France a été brisée. Lorsqu'un calendrier révolutionnaire fut introduit, rompant avec le calendrier chrétien en commençant le 22 septembre 1792 (ce nouveau calendrier comptait douze mois et trente jours avec trois semaines de dix jours), les députés augmentèrent leur déchristianisation, surtout dans les régions où la rébellion avait été déposé. La Commune de Paris a fait de la déchristianisation une politique officielle et des attaques ont commencé à Paris contre les symboles religieux: Saint a même été retiré des noms de rues.