Né le 13 novembre 1814 à Hadley, MA, Joseph Hooker était le fils du propriétaire du magasin local Joseph Hooker et Mary Seymour Hooker. Élevé localement, sa famille était issue d'une ancienne souche de la Nouvelle-Angleterre et son grand-père avait été capitaine pendant la Révolution américaine. Après avoir reçu ses premières études à la Hopkins Academy, il a décidé de poursuivre une carrière militaire. Avec l'aide de sa mère et de son professeur, Hooker a pu attirer l'attention du représentant George Grennell, qui a donné un rendez-vous à l'Académie militaire des États-Unis.
Arrivés à West Point en 1833, les camarades de classe de Hooker comprenaient Braxton Bragg, Jubal A. Early, John Sedgwick et John C. Pemberton. Avancé dans le programme d'études, il s'est avéré un étudiant moyen et a obtenu son diplôme quatre ans plus tard au 29e rang dans une classe de 50. Commandé en tant que sous-lieutenant dans le 1er US Artillery, il a été envoyé en Floride pour combattre dans la Seconde Guerre des séminoles. Là-bas, le régiment a pris part à plusieurs engagements mineurs et a dû faire face à des défis liés au climat et à l'environnement.
Avec le début de la guerre américano-mexicaine en 1846, Hooker est affecté à l'état-major du général de brigade Zachary Taylor. Participant à l'invasion du nord-est du Mexique, il a reçu un brevet de capitaine pour sa performance à la bataille de Monterrey. Transféré dans l'armée du major-général Winfield Scott, il prend part au siège de Veracruz et à la campagne contre Mexico. Toujours à titre d'officier d'état-major, il a constamment fait preuve de fraîcheur sous le feu. Au cours de l'avance, il a reçu des promotions de brevet supplémentaires au grade de major et de lieutenant-colonel. Beau jeune officier, Hooker a commencé à se forger une réputation d'homme à femmes pendant son séjour au Mexique et était souvent appelé le "beau capitaine" par les habitants.
Dans les mois qui ont suivi la guerre, Hooker s'est disputé avec Scott. C'était le résultat du soutien de Hooker au général de division Gideon Pillow contre Scott à la cour martiale de l'ancien. L'affaire a vu Pillow accusé d'insubordination après avoir refusé de réviser les rapports après action exagérés, puis envoyé des lettres au Delta de la Nouvelle-Orléans. Comme Scott était le général en chef de l'armée américaine, les actions de Hooker ont eu des conséquences négatives à long terme sur sa carrière et il a quitté le service en 1853. S'installant à Sonoma, en Californie, il a commencé à travailler comme développeur et agriculteur. Supervisant une ferme de 550 acres, Hooker a cultivé du bois de corde avec un succès limité.
De plus en plus mécontent de ces activités, Hooker s'est tourné vers l'alcool et le jeu. Il a également tenté sa chance en politique mais a été battu dans une tentative de se présenter aux élections législatives. Fatigué de la vie civile, Hooker a demandé au secrétaire à la Guerre John B. Floyd en 1858 et a demandé à être réintégré comme lieutenant-colonel. Cette demande a été refusée et ses activités militaires se sont limitées à une colonisation dans la milice californienne. Débouché de ses aspirations militaires, il a supervisé son premier campement dans le comté de Yuba.
Avec le déclenchement de la guerre civile, Hooker s'est retrouvé sans argent pour voyager vers l'est. Jalonné par un ami, il a fait le déplacement et a immédiatement offert ses services à l'Union. Ses efforts initiaux ont été repoussés et il a été contraint de regarder la première bataille de Bull Run en tant que spectateur. Au lendemain de la défaite, il écrit une lettre passionnée au président Abraham Lincoln et est nommé brigadier général des volontaires en août 1861.
Passant rapidement de la brigade au commandement de division, il aida le général de division George B. McClellan à organiser la nouvelle armée du Potomac. Au début de la campagne de la péninsule au début de 1862, il commande la 2e division du IIIe corps. En avançant dans la péninsule, la division Hooker a participé au siège de Yorktown en avril et en mai. Pendant le siège, il a acquis la réputation de s'occuper de ses hommes et de veiller à leur bien-être. Performant à la bataille de Williamsburg le 5 mai, Hooker a été promu major-général à compter de cette date même s'il se sentait méprisé par le rapport après action de son supérieur..
C'est pendant son séjour dans la péninsule que Hooker a gagné le surnom de «Fighting Joe». Détesté par Hooker qui pensait que cela le faisait ressembler à un bandit ordinaire, le nom était le résultat d'une erreur typographique dans un journal du Nord. Malgré les revers de l'Union lors des batailles de sept jours en juin et juillet, Hooker a continué de briller sur le champ de bataille. Transféré au nord de l'armée de Virginie du major-général John Pope, ses hommes ont participé à la défaite de l'Union à Second Manassas fin août..
Le 6 septembre, il a reçu le commandement du IIIe Corps, qui a été renommé Ie Corps six jours plus tard. Alors que l'armée de Virginie du Nord du général Robert E. Lee se déplaçait vers le nord dans le Maryland, elle fut poursuivie par les troupes de l'Union sous McClellan. Hooker a d'abord mené son corps au combat le 14 septembre, quand il s'est bien battu à South Mountain. Trois jours plus tard, ses hommes ont ouvert les combats à la bataille d'Antietam et ont engagé des troupes confédérées sous le commandement du général de division Thomas "Stonewall" Jackson. Au cours des combats, Hooker a été blessé au pied et a dû être retiré du terrain.
Se remettant de sa blessure, il est retourné dans l'armée pour constater que le major-général Ambrose Burnside avait remplacé McClellan. Commandé d'une "grande division" composée des IIIe et Ve Corps, ses hommes subissent de lourdes pertes en décembre lors de la bataille de Fredericksburg. Longtemps critique vocal de ses supérieurs, Hooker attaqua sans relâche Burnside dans la presse et, à la suite de l'échec de la marche de boue de ce dernier en janvier 1863, ceux-ci s'intensifièrent. Bien que Burnside ait l'intention de retirer son adversaire, il en a été empêché lorsqu'il a lui-même été relevé par Lincoln le 26 janvier..
Pour remplacer Burnside, Lincoln s'est tourné vers Hooker en raison de sa réputation de combats agressifs et a choisi d'oublier l'histoire du franc-parler en termes de franc-parler et de vie difficile. Assumant le commandement de l'armée du Potomac, Hooker a travaillé sans relâche pour améliorer les conditions de ses hommes et améliorer le moral. Celles-ci ont largement réussi et il était apprécié de ses soldats. Le plan de Hooker pour le printemps prévoyait un raid de cavalerie à grande échelle pour perturber les lignes d'approvisionnement confédérées pendant qu'il menait l'armée sur une marche flanquante pour frapper Lee à Fredericksburg à l'arrière.
Bien que le raid de cavalerie ait été en grande partie un échec, Hooker a réussi à surprendre Lee et a acquis un avantage précoce dans la bataille de Chancellorsville. Bien que réussi, Hooker a commencé à perdre son sang-froid alors que la bataille se poursuivait et a adopté une posture de plus en plus défensive. Pris sur le flanc par une attaque audacieuse de Jackson le 2 mai, Hooker est contraint de revenir. Le lendemain, au plus fort des combats, il a été blessé lorsque le pilier contre lequel il était appuyé a été touché par un boulet de canon. Initialement assommé, il a été frappé d'incapacité presque toute la journée mais a refusé de céder le commandement.
En récupérant, il a été contraint de battre en retraite à travers la rivière Rappahannock. Après avoir vaincu Hooker, Lee a commencé à se déplacer vers le nord pour envahir la Pennsylvanie. Dirigé de filtrer Washington et Baltimore, Hooker a suivi bien qu'il ait d'abord suggéré une grève sur Richmond. Se déplaçant vers le nord, il a eu un différend sur les arrangements défensifs à Harpers Ferry avec Washington et a impulsivement offert sa démission en signe de protestation. Ayant de plus en plus perdu confiance en Hooker, Lincoln a accepté et nommé le général de division George G. Meade pour le remplacer. Meade mènerait l'armée à la victoire à Gettysburg quelques jours plus tard.
Dans le sillage de Gettysburg, Hooker a été transféré à l'ouest à l'armée du Cumberland avec les XI et XII Corps. Au service du général de division Ulysses S. Grant, il a rapidement retrouvé sa réputation de commandant efficace à la bataille de Chattanooga. Au cours de ces opérations, ses hommes ont remporté la bataille de Lookout Mountain le 23 novembre et ont pris part aux combats plus importants deux jours plus tard. En avril 1864, les XIe et XIIe Corps sont regroupés en XX Corps sous le commandement de Hooker.
Servant dans l'armée du Cumberland, le XX Corps s'est bien comporté lors de la campagne du major-général William T. Sherman contre Atlanta. Le 22 juillet, le commandant de l'armée du Tennessee, le général de division James McPherson, a été tué lors de la bataille d'Atlanta et remplacé par le général de division Oliver O. Howard. Cela a exaspéré Hooker alors qu'il était senior et a blâmé Howard pour la défaite à Chancellorsville. Les appels à Sherman ont été vains et Hooker a demandé à être relevé. En quittant la Géorgie, il reçut le commandement du département du Nord pour le reste de la guerre.
Après la guerre, Hooker est resté dans l'armée. Il prend sa retraite en 1868 comme général de division après avoir subi un accident vasculaire cérébral qui le laisse partiellement paralysé. Après avoir passé une grande partie de sa vie à la retraite dans la ville de New York, il est décédé le 31 octobre 1879, lors d'une visite à Garden City, NY. Il a été enterré au cimetière de Spring Grove dans sa femme, Olivia Groesbeck, ville natale de Cincinnati, OH. Bien que connu pour sa consommation excessive d'alcool et son mode de vie sauvage, l'ampleur des escapades personnelles de Hooker fait l'objet de nombreux débats parmi ses biographes..